कई अन्य एमपी 3 प्लेयर के विपरीत, एक विशिष्ट संचिका प्रबंधन (
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कई अन्य एमपी 3 प्लेयर के विपरीत, एक विशिष्ट संचिका प्रबंधन (file management) आवेदन के साथ ऑडियो या वीडियो संचिकाओं को बस ड्राइव में कॉपी करना एक आईपोड को ठीक से उन का उपयोग करने के लिए अनुमति नहीं देता.प्रयोक्ता को उस सॉफ्टवेयर का इस्तेमाल अवश्य करना चाहिए जो मीडिया संचिकाओं को आईपोड में स्थानांतरण करने के लिए डिज़ाइन किया गया है, ताकि संचिकाओं को चलाया और देखा जा सके.आईट्यून के अतिरिक्त, कई वैकल्पिक तीसरे दल के अनुप्रयोग (several alternative third-party applications) विभिन्न प्लेटफार्मों पर उपलब्ध हैं.
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